خانه > اخبار > اخبار صنعت

چگونه می توان کیفیت سنتز الیگونوکلئوتید را بهبود بخشید؟

زمان بروزرسانی: 2020-12-23

منبع:

بازدید: 43

چگونه می توان کیفیت سنتز الیگونوکلئوتید را بهبود بخشید؟
سنتز الیگونوکلئوتید سنتی به طور کلی سنتز ستون نامیده می شود ، بر اساس روش سنتز شیمیایی چهار مرحله ای فسفرامیدیت ، که در آن سنتز الیگونوکلئوتید بر روی یک فاز جامد انجام می شود ، و هنوز هم توسط اکثر شرکت های تجاری سنتز DNA استفاده می شود.



در حال حاضر ، سینتی سایزر DNA کاملاً خودکار مبتنی بر روش سنتز فسفرامیدیت می تواند باعث افزایش توان تولید یک سنتز منفرد از یک توالی به 1536 توالی شود. هزینه سنتز الیگونوکلئوتید با روش فسفرامیدیت نیز به تدریج در حال کاهش است.

سنتز ستون معمولاً الیگونوکلئوتیدها را در مقیاس 10 تا 1000 نانومول تولید می کند و هزینه هر پایه بین 0.05 تا 0.17 دلار است. این اولیگونوکلئوتیدها معمولاً می توانند حداکثر 100 سنتته ساخته شوند ، با میزان خطای 0.5٪ یا کمتر ، و بازده اتصال هر مونومر معمولاً تا 99٪ است.

Oligonucleotide synthesis


با این حال ، با افزایش طول الیگونوکلئوتید ، عملکرد الیگونوکلئوتید با طول کامل معمولاً کاهش می یابد. علاوه بر این ، تخلیه تصادفی الیگومرهای مصنوعی بر عملکرد الیگونوکلئوتیدهای تمام قد تأثیر می گذارد ، به ویژه در مرحله محافظت از اسید چرخه سنتز ، آدنین مستعد تخلیه است و در نهایت باعث تقویت ستون فقرات اولیگونوکلئوتید می شود. قطعه ، در نتیجه عملکرد الیگونوکلئوتیدهای تمام طول را کاهش می دهد.



کاهش بیشتر در کیفیت سنتز الیگونوکلئوتید به دلیل معرفی جهش های تصادفی در طی فرآیند سنتز است که عمدتا انواع حذف تک پایه است. چنین خطاهایی عمدتاً از حذف ناقص گروه محافظ DMT یا کارایی کلی پایین مراحل اتصال و درپوش در چرخه سنتز ناشی می شود.

حذف کامل خطاهای مصنوعی غیرممکن است ، زیرا کارایی هرگونه واکنش شیمیایی نمی تواند به 100٪ برسد. با این حال ، پیشرفت در فرآیند سنتز هنوز هم می تواند باعث افزایش طول و کیفیت سنتز الیگونوکلئوتید شود.



جریان اصلی تأمین کننده سنتز DNA عموماً مبتنی بر الیگونوکلئوتیدهای مصنوعی ستونی است. از آنجا که اولیگونوکلئوتید نوع ستونی دارای یک ترکیب واحد ، عملکرد بالا و میزان خطای کم است ، جمع آوری آن برای ساختن ژن راحت تر است و از وفاداری بالاتری برخوردار است ، که این امر سختی کارکرد و هزینه اصلاح خطا را تا حد زیادی کاهش می دهد.



خدمات سنتز الیگنوکلئوتید با توان بالا که توسط Generalbiosystems ارائه شده است ، سختی و هزینه سنتز را از نظر فنی بسیار کاهش می دهد و می تواند نیازهای سفارشی سنتز الیگونوکلئوتید را با عملکرد سنتز بالاتر ، میزان خطای کم و زمان تحویل کوتاهتر بپذیرد. .